3500年前，英格兰早期居民就停止在此地举办任何活动了。直到距今2000年前，“巨石阵”似乎又重新发挥起某种功能来了。早在1923年曾从“巨石阵”地下挖出一具长1.70米的男性骨架，据信是2000多年前留下的。据分析，这名男子是被锋利的铁器从背后砍死的，其头部被全部砍掉，鉴于英国人最早使用铁器是在约2000年前，故此男的死亡时间不会早于此。专家们估计，此男也可能是公元前几百年时罗马帝国入侵英国时被砍死的，因为当时罗马入侵者对任何胆敢反抗的起义领袖均处以极刑。不过也有专家认为，此男可能死于英国王公贵族之间的内斗。
此男性骨架由英国军官霍利发现后即向公众展出，后被保管在伦敦某医学院内。二次大战时，该医学院在德军空袭时被炸毁，但此骨架事先已被成功地转移至乡间。直到去年，专家兼作家皮兹才在一个储藏室里偶然发现了此骨架，并重新对它进行了分析研究。此外，最近在“巨石阵”中央的地下又挖出一个石头造的绞架。
“巨石阵”最令人困惑的是：当时的人们是如何从几百公里以外的威尔士运来这么多每块重达几十吨甚至上百吨的巨石。去年4月，40多名专家进行了一次试验，试图用几千年前的工具和方法将1块重约25吨的巨石从威尔士运来，但花了九牛二虎之力，才将其挪动了100米。据此专家们相信，这些巨石不可能是通过人力运来的，而更可能是由覆盖地面的冰川带来的，但此后显然又经过人为的排列，否则不会在夏至那天与太阳升起的位置恰恰排列成一条直线。
作为健在的“巨石阵”的最重要研究者，阿特金森从50年代起就一直在现场进行实地考察。他的一项最新发现是：几千年来巨石不断被挪走或增加，有的还被运走用于修桥筑坝。由此看来，“巨石阵”在不同的历史时期，在人们心目中的地位可能有“天壤之别”，即有时象征着圣坛，而有时则跌落成普通的石料。
上一世纪80年代，“巨石阵”修复后即成为英国最热门的旅游点之一，每年计有100万人前来游览，其中有不少是专门在夏至那天前来举办“夏至节”的，还有一些游客则自称是古代英国柯尔特人的后代———他们认为相信多种神灵的古柯尔特人即是“巨石阵”的设计师兼建筑师，并在那里举行宗教仪式、解决法律纠纷或向公众发布政令。但据了解，古柯尔特人早在1500年前就从英格兰消失了。而旅游学专家温顿博士则声称，希望对“巨石阵”的考古研究不要进行得过分“深入”，留有“悬念”的“巨石阵”才会对国内外观光者具有“难以抗拒”的魅力。
