第二开晨，驰到茌平县冯官屯。僧格林沁带马队追到，步兵也跟着到来，把冯官屯围困，四面筑炮台，向村内轰击，房屋尽被击塌。太平军在村内掘挖土濠，盘旋三匝，可从地下通行，即在沟内掘窖潜藏，以避炮火。围濠之外，复挖小孔，战士伏在地下，向外瞭望，俟清军逼近，鸟枪打得到的地方，即向上开枪。清军伤亡累累。僧格林沁不敢进逼，他展转筹谋，因冯官屯旁旧有汉河，可通徒骇河，乃用水攻，引放运河以灌冯官屯。

　　太平军从屯内向西南面的清军礮台边开地道，打算轰开缺口突围。三月初八夜（夏历二月二十八夜），先向这一面佯作突围，与清军略一接伏，即诈败退回。清军自以为防守岩密，太平军不会再从这方面来突围了，不加警备。第二夜，太平军就在这裹放地雷把炮台前的濠墙炸塌，立刻冲出，斩杀清军。清军仓卒失措，四散逃命。时炮台外还有围濠一道，太平军正在赶急填濠，僧格林沁已闻警，飞调大军到，扼濠堵截。太平军苦战不能过濠，乃把炮台上的大炮和其他军器一起俘获，从容退回沟内。清帝奕詝得败报，命军机大臣傅谕僧格林沁等欢息说：「甚至伤亡兵勇，遗失炮位，似此情形，……以万馀兵勇，围数百之贼，百计经营，迄无把握，朕心宝深焦灼」。

　　三月十三日（夏历三月初四日），清军引河工竣，第二天，放水淹浸，围堤以内，高处有水三、四尺，低处水深至五、六尺，太平军潜伏处，都有水三、四尺，火药、穀麦半被水浸。在水淹的第二天，太平军在西北面清军炮台附近埋的地雷，其火药袋、火药篓都被水漂出。从此地已遭水淹，不可能再用地雷轰塌围墙。三月二十九日（夏历三月二十日）以后，水势已经成围，难以飞渡重濠，但英勇的太平军决不在困难前低头，连夜向清军南北炮台进攻，企图突围，终因兵力太相悬殊，敌人又靠大水作围，都被阻截退回。

　　僧格林沁要活捉开芳，假说爱他才干，望他来投。开芳正在无计可施，以为何不如将计就计，竟出下策，於四月二十一日（夏历四月十三日），先派心腹先锋黄近文带领将士一百四十多人，混入难民内，齐出诈降，在外接应。他看见僧格林沁把诈降的将士用小船渡出重濠，以为敌人中计，到二十四日（夏历十六日）晨，大凤骤起，飞沙扬尘，瞬息不辨南北。他就写一封诈降信给僧格林沁。僧格林沁要他先缴械。开芳带领将士，全副武装，乘坐小船，伪作前来缴械。他以为僧格林沁受降不会作防备，又有黄近文等在外接应，天又大凤蔽日，正是突围的好时机，一到濠边，就可以乘此脱逃。不料僧格林沁早已看出他的诈降，先把黄近文等都杀死，绝了接应，到要渡他出濠时，又暗派马步队万多人张左右翼包围着。开芳既人敌人彀中，和将士都在濠边被擒。

　　僧格林沁将李开芳及他的部下黄恣端、谢金生、李天佑，谭有桂、韦名傅、曹得相，槛送北京，其馀将士一百多人，都在冯官屯被杀牺牲。开芳在路绝食，槛送官员屡次婉劝，均拒不食。