研究队伍处于新老交替的时期，如果不改变这种状况，东北边疆历史与现状研究的发展必然会受到进一步影响。四是目前东北疆域历史与现状研究中“禁区”林立，非学术因素对研究的制约、干扰未得到根本性改变。东北边疆历史与现状研究关系国家利益，涉及外交政策、民族政策、国际关系等敏感问题，受到历史和现实的影响，研究中“禁区”大量存在，制约了研究的正常开展。诸如课题立项困难，经费难以落实，成果发表受到限制等，严重挫伤了研究者的积极性。这种状况近20多年来虽然在逐步改善，但有些“禁区”及其所带来的影响仍然存在。
面对挑战，会议认为对管理部门来说，当前解放思想更具有紧迫性。一是要充分信任中国学者的爱国主义传统精神和求实求真的治学风范;二是要相信在维护国家利益的大是大非问题上，学者的声音可以弥补政府声音的欠缺与不足，起到互补的功能。果能如此，管理部门在维护国家外交大局的前提下做到以下几点也就顺理成章了。一是政府应保护中国学者表达自己观点的权利、学术见解的不同，鼓励进行心平气和的讨论，认识不一致的可求同存异;凡有人想混淆研究与决策界限，应予澄清;有人若借学术见解的不同无理取闹，甚至制造事端，应予坚决驳斥。二是政府应采取有力措施鼓励学术界系统、全面地开展东北边疆历史与现状研究，要为学者出版相关专著、发表论文提供宽松环境，但应避免一哄而上，重复出版。三是应放手让中国学者参加相关国际学术讨论，鼓励和保护中国学者在国际学坛上为维护国家利益、促进学术发展所做的工作，要为让更多的学者的声音出现在国际学坛上创造条件。四是对一些遗址，特别是高句丽、渤海遗址加强管理并不是将有关遗址封闭，不让中国学者在研究工作中加以适当利用，而应该开放，加强高句丽文物遗址讲解、宣传的把关审定。
迎接挑战，会议认为应启动“东北边疆历史与现状系列研究”工程，将东北边疆历史与现状研究纳入学术化轨道，将基础研究与应用研究有机结合，深化研究，在3-5年时间里完成一批有较高水平的研究成果。
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