白天，“普韦布洛”号的活动位置都在距离朝鲜东海岸14海里以外的公海(国际海洋法公约规定的领海范围为12海里)，夜间则为了避免因导航偏差误入朝鲜领海，而一直退到距离海岸20海里以外的公海。

1月22日，“普韦布洛”号驶往朝鲜重要港口元山的外海。次日是“普韦布洛”号侦察行动的最后一天。这天，“普韦布洛”号一改前些天的谨慎做法，缓缓驶至朝鲜东海岸约12海里处，并打开了所有侦察设备，接收朝鲜的无线电信号，频频向日本总部发回密码。

朝鲜战舰战机突然拦截

其实，“普韦布洛”号早在两天前就已经被另一事件推上了风口浪尖。

1月21日深夜，几名身着韩国-的朝鲜第124部队的突击队员潜入韩国首都汉城，直到距离总统府青瓦台只有一个街区处才被发现并消灭。这就是著名的“青瓦台事件”。

根据以前的惯例，朝鲜在与韩美发生摩擦之后必定会再次行动，以达到打击敌人、振奋民心的目的。美国驻日海军情报部门根据当时的紧张局势，建议“普韦布洛”号立即返航，却遭到否决。

然而，朝鲜方面早就发现了行踪诡秘的“普韦布洛”号，迅速作出了反应。

1月23日中午时分，布克接到报告，说一艘朝鲜猎潜艇正快速逼近，他当即赶到信号台。这时，从电台的国际航海通用频率中传来了朝鲜猎潜艇的询问：“你们是什么国家的船只？”布克连忙下令升起美国国旗表明身份。此时，又有4艘朝鲜鱼雷快艇急速赶到。猎潜艇接着又发出“立即停船，否则就要开火”的要求，“普韦布洛”号迅速回复说：“我是一艘海洋科学考察船，正在执行考察作业。”这时，朝鲜的米格战斗机也出现了，并在“普韦布洛”号上空盘旋。朝方接着要求：“你船必须马上跟随我船靠岸检查！”但布克置之不理，指挥船只逃跑，由于遭到朝鲜鱼雷艇的拦截，船速极慢。

布克只好下令破坏船上的电子设备、销毁机密文件。于是，船员们一边手忙脚乱地用斧子和榔头猛砸先进的电子仪器，一边用 打火机焚烧机密文件，实在来不及处理就朝海里倒。

朝鲜舰艇立即组织武装人员和10多名水兵登上“普韦布洛”号，结果发现船上只有小部分设备和文件被破坏，大量有价值的航海日志和无线电情报等重要文件均完好无损。

中苏朝联手反击战争威胁

“普韦布洛”号落入朝鲜之手的消息震惊了整个美国。美国立即使出其惯用的武力威胁手段，将轰炸机和F-4、F-105等数百架战斗机调到韩国乌山和群山等空军基地。

面对美国的大兵压境，朝鲜人民军最高司令官金日成命令朝鲜人民军、工农赤卫队和全体人民做好一切战斗准备。1968年2月8日，朝鲜通过媒体发出警告：朝鲜将“以报复来回答报复，以全面战争回答全面战争！”半岛局势一触即发。

但是，美国突然“软”了下来，沉默了一个月后才发表了谴责声明，而且声明除了要求朝鲜归还船只、释放船员外，并没有发出报复的威胁。为什么呢？

这是因为美国当时正深陷越南战争泥潭，没有足够的机动兵力与朝鲜一战。更令美国心虚的是，中国和苏联等都以各种形式表示了对朝鲜的支持，并准备随时支援朝鲜。

在发表谴责声明后，美国主动提议谈判解决“普韦布洛”号事件，朝鲜顺势接受，和美国开始了历时近一年的马拉松式谈判。失去了武力恫吓的法宝，美国在谈判桌上节节败退，最后完全接受了朝鲜方面提出的“3A”条件，即Ac-knowledge(承认错误)、Apologize(谢罪道歉)、Assure(保证不再发生此类事件)。

1968年12月23日，美国政府承认其电子侦察船侵入朝鲜领海，并发表书面声明进行道歉。同日，朝鲜外务省发表声明，称鉴于美国“普韦布洛”号船员“坦白供认”其侵犯朝鲜领海的罪行并一再请求宽恕，而且美国已于当天向朝鲜“赔礼道歉”，朝鲜政府宣布没收该船以及船上所有的设备和武器，将全部船员驱逐出境。同一天，朝鲜把“普韦布洛”号上的82名被俘船员以及一具死亡船员的尸体在板门店移交给了美方。至此，历时11个月的“普韦布洛”号间谍船事件终于结束。

对朝鲜而言，“普韦布洛”号间谍船是它在与美国几十年的斗争中缴获的最辉煌的战利品，因此一直将其停泊在大同江港口内，供民众参观，作为爱国主义教育基地。2002年10月，为了与美国缓和关系，朝鲜曾考虑过归还“普韦布洛”号。但不久后爆发的朝核危机阻碍了这一想法变成现实。后来，随着核危机的发展，这一想法也就不了了之了。