随着祭司集团在经济领域中实力的增长，他们的*野心也增长起来，不再甘心作王权的附庸。在第18王朝中叶，王室内部发生了哈特舍普苏特同图特摩斯三世之间的争权斗争，斗争的双方都去寻求阿蒙神庙祭司集团的支持。这件事给了阿蒙神庙祭司集团扩大其*实力，插手*，尤其是插手王室内部斗争的机会。哈特舍普苏特女王的两个宠臣森穆特和哈普辛涅布都是阿蒙神庙祭司（前者是女王的总管，后者是女王之下的维西尔）。在女王晚年或女王死后，祭司们又拥戴了图特摩斯三世复位。对此，才22岁的图特摩斯感激不尽（很可能，他在被哈特舍普苏特女王贬到阿蒙神庙去当祭司时，就同祭司结下了友谊）。所以，他在每次胜利的战争后，都要给神庙很多战利品。如有一次，他给了神庙2800斯塔特土地，还有1078个奴隶，以及其它财富。

神庙集团在经济上和*上实力的增长，不仅危及其它奴隶主的利益，而且逐渐危及王权。在阿蒙霍特普三世统治时期，这种情况大概已使王权再也不能忍受了。因此，这位法老撤了祭司兼维西尔的普塔赫摩斯的职，而任命了一位非祭司集团的拉莫斯担任维西尔，以取代普塔赫摩斯。这使王权与神庙祭司的矛盾表面化了。

阿蒙神庙势力对王权的威胁，不仅使法老对阿蒙神庙祭司产生了疑虑，而且也对阿蒙神的信仰本身产生了疑虑。因而，早在图特摩斯四世时代，一个古老的太阳圆盘神阿吞神便被抬了出来加以崇拜。在一次对西亚的纳哈林的远征胜利后留下的纪念性铭文中，图特摩斯