第一阶段（1956年~1965年）
　　两次全国性的考古发掘大会战，发掘侯马铸铜遗址、侯马盟誓遗址、西侯马陶窑遗址、北西庄祭祀遗址、上马墓地和乔村墓地等等。在侯马以外地区发掘万荣庙前村东周墓地、天马—曲村遗址等等。
　　第二阶段（1966年~1988年）
　　发掘侯马乔村墓地、上马墓地、新绛县柳泉墓地、稷山金墓，侯马城内近千座祭祀坑，发掘四处晋国宗庙建筑遗址、侯马北坞古城、东呈王村新石器时代遗址。建立了金元墓葬保护研究中心。
　　第三阶段（1989年至今）
　　在侯马晋国遗址，调查发掘了西南张祭祀遗址、西高祭祀遗址等一大批祭祀遗址和宗庙建筑遗址下平望墓地、乔村墓地、虒祁墓地、东高墓地、北郭马古城、平阳宾馆制陶作坊遗址等等。在乔山底村发掘了新石器时代遗址。
　　在侯马以外地区对永济县唐代蒲津渡遗址、襄汾县大张墓地、翼城县上石墓地、洪洞县永凝堡墓地、浮山县南霍墓地、浮山县乔北墓地、乡宁县内阳垣墓地、夏县崔家河墓地、曲沃县望绛墓地、曲沃县羊舌墓地、曲沃县晋侯墓地、绛县横水北墓地等进行了抢救性发掘，发掘的遗址有夏县西阴村、闻喜县中庄村新石器时代遗址，进行绛县“故绛”遗址调查。