崔银秋等在《考古》２００５年第７期发表《吐鲁番盆地青铜至铁器时代居民遗传结构研究》一文认为，实验中对古代样本的遗传分析结果显示吐普番群体具有混合人群的特征，与形态学分析结果一致。众所周知，欧洲和东亚的谱系之间几乎无交叉共有序列。但吐鲁番古代人群同时具有两者的序列。同时，从核酸多样性、配对差异分析及遗传距离上，吐鲁番古代人群均处于欧洲和东亚群体之间。本文的研究表明，早在青铜及铁器时代，吐鲁番盆地已存在欧亚谱系混合现象，而吐鲁番古代人群比现代新疆土著群体在遗传距离上更接近于欧洲群体。这说明在古代新疆地区，欧洲谱系对当时人群的遗传结构的影响比现在要大，随着西迁的东亚群体逐渐增加，欧洲谱系的影响在新疆地区呈弱化的趋势。