如果邓铿认得与陈炯明有关，他怎么会在受伤后马上返回省署（陈炯明办公的地方），又命人通知陈炯明呢？密切关注局势发展的驻穗美、英两国领事馆也认为，剌杀邓铿，是孙派国民党所为。1990年留美历史学家汪荣祖博士，依据湮没已久的史料，包括英、美两国国家档案局里的情报，对邓铿之死的真相，作了仔细的研究与分析。汪教授的结论说：“孙中山谋害邓铿，是北伐军改道攻赣回粤时，对付陈炯明杀鸡儆猴的一着棋。（陈定炎、高宗鲁《一宗现代史实大翻案——陈炯明与孙中山、蒋介石的恩怨真相》）”这可以说是
导致陈炯明与孙中山决裂的破口。
　　4月9日，陈炯明因无法接受孙中山提出的参加北伐、筹措500万元军费的条件，遂被罢黜。
　　6月2日，北洋总统徐世昌无法承受巨大的压力，宣布辞职。由于孙中山曾一再发表-宣言，承诺只要徐世昌下台，他亦将同时下野。
　　6月3日，蔡元培、胡适、高一涵等两百多位各界名流，联名致电孙中山和广州非常国会，呼吁孙中山实践与徐世昌同时下野的宣言，可见，孙中山的下野在当时是颇得人心的。蔡元培等使用舆论，后文中提到的叶举等使用武力，目的都一样——“要求孙中山下野”，只是手段不同。
　　5月20日，驻守在广西的粤军，听到陈炯明下野的消息后，顿时沸反盈天，在叶举的带领下，六十多营粤军，突然开入广东省城。把只有两营警卫的孙中山重重围困在广州。孙设宴招待粤军将领，没有一个高级军官应邀，只来了几名中下级军官，孙对他们说：“告诉你的长官，不要以为据守白云山，便可胡作非为，我立刻上永丰舰，驶入东江射击你们，连你们的根据地也一并铲除！现在东江水涨，永丰炮舰可以直行驶入陈炯明的老巢。”

而此时的陈炯明则在惠州隐居。孙中山一连拍了三张电报，要求陈炯明立即到广州面商一切，又派人到惠州催驾。但陈炯明拒绝在这个时候到广州。并说，在省城军队没有撤出广州之前，他都不打算到广州。他不想被人误解。
　　6月12日，孙中山邀请广州报界出席茶会，他决心通过报纸，向陈炯明摊牌，他宣布：我下令要粤军全数退出省城30里之外，他若不服命令，我就以武力压服他。人家说我孙文是车大炮（讲大话），但这回大炮更是厉害，不用实心弹，而是用开花弹，或用八英寸口径的大炮的毒气弹，三小时内不难于把他六十余营陈家军变为泥粉。但残害六十余营官军，且惊动全城的居民，不免过于暴烈，但我不如此做者，他们终不罢休。我只望报界诸君，主持正义，十天之内，做足工夫，对于陈家军，加以纠正。陈家军若改变态度，即不啻
如天之福，万一无效，就不能不执行我海陆军大元帅的职权，制裁他们了。（1922年6月1
9日《申报》）
　　在此紧要关头，在惠州的陈炯明派秘书陈猛荪持亲笔信劝止叶举……叶举阅后，当着陈猛荪的面将信掷落地上，……叫陈猛荪回报陈炯明事情已不容不发……陈炯明听后，怒不可遏地把茶盅也打碎了。（据《叛孙前后的陈炯明部队》）叛乱不可避免地发生了，但叶举等人并不想致孙中山于死地，只想将孙赶出广东，所以他们在开炮前让人打电话给孙透露消息，让他赶快逃跑。所谓“炮轰总统府”，是府内守军拒绝被粤军缴械解散，粤军开土炮“三响吓之”。在当年香港出版的中、英文报章，遍找不到粤军有“炮轰总统府”的标题新闻，而却有孙中山于次日（6月17日）下午，以海军大炮乱轰广州市区的大标题新闻报道！（据陈炯明之子陈定炎反驳马失途刊登于1998年3月11日至12日的香港《信报》“陈炯明也可以翻案吗？——一本有争议新书发表会侧记”——《我为什么要翻案》）
　　6月17午后一时半，孙中山率领永丰等七舰，“在省河海珠，天字码头前处开炮轰击，又向白云山、观间山、大沙头（广九车站），沙河等处遥远射击”。午后五时，又重行开炮，两次炮轰，“炮声前后将及百响，子弹横飞，四散堕下……房屋损失估计总共不下五百万元，平民死伤，总在百人以上。”（据陈定炎、高宗鲁《一宗现代史实大翻案——陈炯明与孙中山、蒋介石的恩怨真相》）
　　这个真实的“陈炯明”显然与历史教科书所塑造的“陈炯明”形象不同，这个“陈炯明”只不过是一个与孙中山政见相左，尔后受到孙中山打击的军阀头领，同时他在民主思想上反而要比孙中山先进，他也能将这种民主思想付之实施。用其子陈定炎的话说：“我父亲代表孙中山追求现代化过程中的一个阶段。”历史教科书上的“陈炯明发动叛乱，炮轰总统府”一说纯属无稽之谈，陈只阻止，没有发动叛乱。若说有炮轰当时却有孙中山炮轰广州城一事。