王守澄为左右神策观军容使，兼十二卫统军，明升暗调，夺去了王守澄的兵权，而把仇士良封为左神策中尉，掌握了神策军的军权。王守澄失去了禁军兵权，不久被派一使者毒死在家里。
除掉王守澄，文宗、郑、李想趁机把专权拔扈的宦官一网打尽。李训、郑注二人并不完全齐心协力。当郑注前去凤翔(王守澄死后葬于凤翔，所有太监都去送葬，想借此用兵杀掉太监)准备去了，而李训与宰相舒元舆合谋改变了事先定好的计划。
公元835年(太和九年)11月的一天，文宗到紫宸殿视朝，百官参拜后，左金吾卫大将军韩约奏报：“左金吾卫中庭后面的石榴树上，夜里降下甘露。”这被认为是国家的祥兆，李训和舒元舆率百官向皇帝祝贺，并劝皇帝去看看，文宗就带百官到左金吾卫旁边的含元殿。文宗要李训先去看看是否真有其事。李训去后回来说：“甘露不一定是真的，不可立即宣布。”李训建议再派仇士良等宦官去仔细观察。事先李训已在左金事吾卫的院里帐慢后面埋伏了几百名金吾卫将士。韩约领着仇士良等太监，离开含元殿来到金吾卫，韩约由于紧张竟汗流不止，引起仇士良的怀疑，这时风吹帐幔，掀起一角，露出埋伏的将士，仇士良大喊一声“不好，退回!”太监们纷纷退回含元殿，有一些太监抓过一乘轿子，把皇帝塞进轿子，踢开殿后的屏风，抬着皇帝便走，到宣政殿，关上殿门，仇士良立召神策军。金吾卫的将士追皇上没追上，只杀死了几个太监，李训此计没杀掉仇士良等人，却使皇帝被太监抢走。太监掌握了皇帝，可以任意以皇帝的名义发布诏令，仇士良已完全掌握了朝中大权，这就是历史上有名的“甘露之变。”
甘露之变以失败告终，掌握了朝中大权的仇士良，知道文宗也参预这次谋杀宦官的政变，心中怀恨，常对文宗无理，文宗也无可奈何。仇士良命左右神策副使率军队以搜捕盗贼为名，大肆杀戮金吾卒，死者甚众，可谓“横尸流血，狼藉涂地。”宰相舒元舆便装单骑出逃，被禁兵追擒，七十岁宰相王涯也被逮入狱，屈打成招，一家全被逮捕。禁军借机烧杀掠夺，京城的一些不法分子也趁机抢劫，整个京城一时血雨腥风，人人自危。
文宗上朝，见百官缺许多人，就问“宰相为何不来上朝?王涯为何不来上朝?”仇士良奏曰：“王涯谋反。”然后呈上王涯自供书，文帝不信，就问左仆射令狐楚：“是王涯的手迹吗?”令狐楚看后答曰：“是的。”后来令狐楚密奏皇帝说：“王涯谋反一事，未必可信。”仇士良知道后大为恼火，从此排挤令狐楚。
事败后李训出逃，被擒斩首。几天后，王涯、贾馀、郭行馀、王璠一同被斩，仇士良令百官临观，他们的家属完全被杀，婴女也不例外，后来又杀了韩约、郑注。自此，“仇士良等各进阶迁官有差，自是天下皆决于北司，宰相行文书而已。”
两宰相在“甘露之变”被杀后，郑覃、李石拜相，仇士良总把自己凌驾在两相之上，两相欲奏事，常常遭仇士良斥责。朝纲混乱，李石也时常与仇士良抗争，以图振举朝纲，强皇权，甚至敢反问仇士良：“训、注为乱首，但不知训、注始因何人得进?”仇士良对李石恨之入骨，又无法公开除掉他，就采取暗杀手段。
公元838年(开成三年)正月，李石骑马上朝，中途遭到刺客射杀，马受惊后驮其回府，不料府门外也埋伏着刺客，刺客挥刀来砍李石，砍断马尾，李石幸免。文宗知道后大惊，命神策遣兵护卫李石，并下诏追捕刺客，未得。百官惊惧，甚至有人不敢上朝了。为了免遭杀身之祸，李石向文宗上表请求辞去相位，文宗无奈，只好让李石挂相衔出任荆南节度使，这时朝中再没有一个敢直面仇士良的人了。
仇士良的爪牙们倚仗仇的权势，在京城地区姿意横行，京兆尹张仲方惧不敢管胡作非为的禁军，被改为司农卿。而薛元赏作了京兆尹，一次，元赏到李石家拜会，刚到府中，听到李石与人在厅中争吵十分激烈，便派人去偷看，原来是神策将军与李石在吵，薛元赏快步走进厅中，对李石说：“相公辅佐天子，纲纪四海，今近不能制一将军，使无礼如此，何以镇服四夷!”然后密命自己的护卫等在下马桥旁，神策将军出来经过时，擒住，等元赏来到时，神策将军已跪在道旁听候处置了。这时，有党羽飞报仇士良，仇士良派一宦官赶来说：“中尉请京兆尹前去有事商量。”薛元赏说：“属有公事，行当继至。”遂杖杀了神策将军。然后，薛元赏换上待罪的服装到仇士良那里，仇士良盛气凌人地质问：“痴书生何敢杖杀禁军大将!”薛元赏说：“中尉，大臣也，宰相，亦大臣也，宰相之人若无礼于中尉，如之何?中尉之人若无礼于宰相，庸可恕乎!中尉与国同体，当为国惜法，元赏以囚服来，惟中尉死生之!”薛元赏不亢不卑的一席话，使仇士良锐气减了许多，又想神策将军已死，元赏所说符合法律，不好治罪，就强装欢颜，留元赏饮酒，显示出了仇士良的狡黠，不能加罪就笼络，把报复埋在心里。此事后，禁军们收敛了许多。
公元839年(开成四年)11月，得病的文宗在思政殿闲坐，问值班的学士周墀：“你说朕象前朝的哪一代君主?”周墀回答：“陛下乃尧舜之主!”文宗摇摇头，叹口气说：“朕怎么敢比尧舜，我所以问你，是让你看我象不象周赧王和汉献帝?”周赧王和汉献帝都是亡国之君，周墀十分吃惊，急忙说：“他二人怎比陛下的圣德!”文宗说：“他二人是受制于诸侯，而今朕是受制于家奴，从这一点来说，联还不如他二人吧!”说着眼泪流下来。
公元840年(开成五年)文帝病死，他诏令侄子敬宗继位，仇士良因为敬宗不是他立的，就杀了敬宗，另立文宗弟李炎为皇帝，即武宗，年号会昌。因武帝是自己立的，仇士良更加猖獗，竟对武宗指手划脚，凡武宗所宠的人，无论乐工，还是内侍，皆诛杀贬谪。武宗刚毅果断，喜怒不行于色，对于仇士良采取“内实嫌之，阳示尊宠”的办法，接着任用李德裕为相来排斥仇士良。仇士良已感觉出自己被武宗疏远，于是就用鼓动禁军闹事的阴谋妄图挤走李德裕，夺回自己的地位。公元842年(会昌二年)10月，李德裕起草赦书，减禁军衣粮及马刍粟，便鼓动禁军哗变，围攻李德裕，借此铲除他。李德裕看穿了仇士良的阴谋，急速求见武宗，武宗大怒，立即派人对神策军宣旨：“赦令自朕意，宰相何豫?尔渠敢是?”于是风波平息，仇士良未得逞，至此后，仇士良日夜不安，自知作恶多端，说不定那天就大祸临头。不久，武宗就把他削为内侍监，知省事。843年(会昌三年)，他请求告老还乡，太监送他走，他还对党羽们传授驾驶皇帝的经验：“不要让天子闲着，应该常常以奢靡来掩住他的耳目，使他沉溺于宴乐中，没工夫管别的事情，然后我辈才能得志。千万不要让他读书，不让他接近读书人，否则，他就会知道前朝的兴亡，内心有所忧惧，便要疏斥我辈了。”
武宗并没有放过他，第二年，削去他的官爵，抄了他的家，仅留下他一条性命，不久，仇干良病死。
身为宦臣的仇士良，一生弄权干政，在宫中侍奉六主，拥立二帝，专权二十多年，大肆杀戮朝臣，凌驾于天子朝臣之上，可谓恶贯满盈。
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