皇太极崩而福临能即位，确实是孝庄的功绩。在一段时间内，皇太极的弟弟多尔衮大权在握，且又首先入关，“一片石”大败李自成而占领北京，他可以称帝但没有称帝，后辈子侄中豪格亦想称帝，被多尔衮诛杀。究其原因，是有孝庄在其中周旋。多尔衮与太宗有多重关系，一方面是兄弟，但有杀母之仇，一方面太宗对他又有养育之恩，恩怨纠结，以致许多事情不可思议，孝庄在此时的作用便极为重要。由于孝庄的插手，六岁的儿子福临顺利地当了皇帝，形成了清朝父位子承的皇位继承制度，而孝庄却为皇太极福临父子背上了“太后下嫁”的丑名。“太后下嫁”其实是子虚乌有之事，但康熙虽贵为皇上，却无法破此谣言，终不能堵好事者之口。

　　康熙得以为帝，亦是孝庄与德国传教士汤若望一再申明利害，方使顺治皇帝吸取自身的教训而定下了将已出过痘的玄烨为继位者。康熙八岁登基，而辅政大臣多自以为是，于是太皇太后便成了小皇帝的最大支持者。后来发生了一系列事件，使康熙明白了自己的权力，形成了自己的思想，尤其是孝庄在康熙四年对汤若望凌迟处死的开释，及对中国使用西洋历法的支持，都开启了康熙一生喜研科学唯是是从的文化政策，终于使康熙从一个八岁丧父九岁丧母的儿童，成长为圣明君主。可以说孝庄一生为清初三位皇帝服务，尽心尽责，披肝沥胆，用尽了聪明才智。所以，康熙孝顺祖母之举，不独自有帝皇以来所未有，即平常百姓家亦为罕见。孝庄崩后，他必欲于宫中独行三年，到了二十八年岁末已将近两年，三年之丧以二十七个月计，也将届满，而赵执信、洪升竟因“非时演剧”被予斥逐，这个处分过于苛刻，与康熙的个性不符，给人的感觉，康熙除了纯孝之外，还对祖母怀有一份非常浓重的歉疚，而渴思有所弥补。

　　其实这歉疚就是康熙不可告人的隐痛，即孝庄太皇太后不独无负于太宗，且当为太宗感激于泉下，恪于世俗礼法，却又不能与太宗同穴。孝庄太皇太后所负的不白之冤，康熙知其故而不能言。贵为天子，富有四海，权力可以决定任何人的生死贵贱，独独对祖母的奇冤无法昭雪，康熙的隐痛百倍于常人是可以理解的。

　　后来，康熙将慈宁宫之东新建的五间宫殿拆运到孝陵近地修建暂安奉殿，就是因为这几间宫殿是太皇太后在世时所喜欢的。可就是把故宫全部拆去，也无法平抚康熙的隐痛，这便是康熙一生未能下葬祖母的原因。