为了巩固初建的明王朝，他分封诸于为藩王，镶守重地．对百官实行特务统治，屡兴大狱。其中最主要的两次是胡惟庸案和蓝玉案，株连杀了数万人，开国功臣几乎被除去大半。这些做法有其一定的局限性，但在治国之初采用一些严厉的手段，对巩固封建政权是有利的。洪武三十一年(1398年)，当了31年皇帝的朱元璋病死，终年71岁，遗诏命皇太孙朱允火文继位。葬于孝陵，谥曰高皇帝，庙号为太祖。