同年底，呤唎偕同他的未婚妻葡萄牙人玛丽，以及他的朋友英国人埃尔和希腊人腓（fei肥）力普来到太平天国都城天京（今南京），由他介绍，他的未婚妻和朋友们都加入了太平军，当时，太平天国正在集中力量解除安庆之围，呤唎奉命率领一支炮队随军救援，太平军在江西鄱阳湖一带大败清军，呤唎的炮队发挥了重要作用。此后，呤唎长期在李秀成的部队从事各项工作，如训练炮队，采办粮食、-，宣传太平天国革命，介绍外国人来太平天国参观等；他还多次出生入死，亲自参战。1862年5月，呤唎率炮队随太平军包围上海附近的松江，重创美国人华尔的“洋枪队”、英法联军及清军，击毙了好几个侵略军头目。次年6月，呤唎和他的妻子玛丽同太平军将士一起。守卫天京对岸的九洑（fu伏）洲炮台，面对清军的猛扑，浴血奋战。在这次战斗中，玛丽壮烈牺牲，呤唎也负了伤，他们和太平军将士的鲜血，共同洒在了中华大地上。

1864年初，呤唎奉命到上海采办军械，清朝地方官府侦知到他的行踪，英国当局发出通缉他的命令。当时，由于连年艰苦的战争生活，呤唎积劳成疾，身患重病，不得不怀着依依惜别的感情离开并肩作战将近四年的太平军，回到英国治疗休养。

尽管后来太平天国革命被中外反动派联合绞杀了，但呤唎对中国人民的正义斗争始终怀着深厚感情。1866年，他写成《太平天国亲历记》一书,热情宣传太平天国革命，同时揭露、抨击了清政府和外国侵略者互相勾结，共同镇压太平天国的罪行。呤唎一直对参加太平军的历史感到光荣和骄傲，1872年他与海伦·艾米·巴特勒小姐结婚时，还特意在结婚证书上写下自己是“前太平军陆军上校”的荣誉头衔。

1873年3月29日，呤唎因心脏病猝发在伦敦逝世，年仅三十三岁。呤唎作为近代最早投身于中国反封建，反侵略斗争的外国人，他的事迹将永载史册；他的革命精神和国际主义精神，将永远受到中国人民的纪念。