过去研究中医药学史所依据的文献，基本上是传世文献，一个世纪以来有关上古的出土文献，特别是简帛文献的问世，使人们不得不重新认识上古中医药学史，因为简帛中有大量不见于传世文献的佚医书，且绝大部分的成书时间都比传世中医药文献早，所带来的信息强烈地冲击着传统观点。传世医籍最早者是《黄帝内经》，[1]而简帛医籍中有不少都比它早，并且，仅马王堆医书中，就有不少迄今为止所知的最早的医药学文献，如：《足臂十一脉灸经》、《阴阳十一脉灸经甲本》和《阴阳十一脉灸经乙本》，是迄今所知最早的古经脉学著作。《脉法》和《阴阳脉死候》，是迄今所知最早的古诊断学著作。《五十二病方》是我国现已发现的最古医方著作。
经脉学是中医学的基本学说之一，《黄帝内经》中所讲的经脉为十二条，此学说一直沿用至今，而简帛经脉学书都只讲了十一条经脉，较《内经》缺少一条“手厥阴脉”。不光说明这些经脉佚书是较原始的著作，同时说明我国的经脉学说经过了一个较长的产生发展过程。
从大量的简帛医籍可知，至少在秦汉时期，我国的传统医学已建立起内科、外科、妇科、房中、导引，及兽医、法医等医学学科，同时，简帛医籍还给我们展现了解剖学、诊断学、临床医学等各个方面的生动画面，如《五十二病方》中治一种叫“牡痔”的痔疮的以下两个方子：
有蠃肉出，或如鼠乳状，末大本小，有空（孔）其中。囗之，疾（灸）热，把其本小者而戾绝之，取内户旁祠空（孔）中黍腏、燔死人头，皆冶，以膱（脂）膏濡，而入之其空（孔）中。（239～240）
　　 牡痔居窍旁，大者如枣，小者如枣核者方：以小角角之，如孰（熟）二斗米顷，而张角，絜以小绳，剖以刀，其中有如兔（菟）实，若有坚血如抇末而出者，即已。令。（244～245）
以上二方给我们展现的是当时外科治疗痔疮的活生生的画面。这些，显然为临床医学史的研究提供了极其生动的历史资料。