据初步统计，《四库全书总目》一共评介了37部明末清初在华传教士及其协作者的著作。这些著作，有的收入了《四库全书》，有的仅为存目。考察《四库全书总目》对这些著作的评价，有助于我们认识清朝官方对西方科学的态度。
对西方天文历算的赞赏
《乾坤体义》是利玛窦的一部科学著作。《四库全书总目》充分肯定了此书的新颖之处，认为：是书上卷皆言天象，下卷皆言算术，“虽篇帙无多，而其言皆验诸实测，其法皆具变通，可谓词简而义赅者。是以《御制数理精蕴》多采其说而用之。”
《表度说》是讲立表取日影，以知节气时刻之书。《四库全书总目》介绍道：“是书大旨言表度起自土圭，今更创为捷法，可以随意立表。”书末“言表式表度，并节气时刻推算之法，绘画日晷术，皆具有图说，指证确实。”
《天问略》是与《表度说》次第相承，互为表里的书。《四库全书总目》指出：是书于诸天重数，七政部位，太阳节气，昼夜永短，交食本原等，“皆设为问答，反复以明其义。末载朦影刻分表，并详解晦朔交食深浅之故，亦皆具有图说，指证详明。”但是 ，该书“欲借推测之有验，以证天主堂之不诬，用意极为诡谲。” “然其考验天象，则实较古法为善。今置其荒诞售欺之说，而但取其精密有据之术，削去原序，以免荧听。其书中间涉妄谬者，刊除则文义或不相续，姑存其旧，而辟其邪说如右焉。”这一段评介充分体现了清朝官方“节取其技能，禁传其学术”的思想。
《简平仪说》论述了天文观察仪器简平仪的原理及其使用方法。《四库全书总目》评价道：“盖是仪写浑如平，如取影于烛，虽云借象，而实数出焉。弧三角以量代算之法，实本于此。今复推于测量，法简而用捷，亦可云数学之利器也。”
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