在今后3年至10年内，除完成《中国边疆通史》(多卷本)、《中国古代疆域史》、《中国近代边界沿革吏》、《新疆史鉴》外，还将视条件逐步开展《中国边疆学通论》、《中国封建时期藩属研究》、《中国历代的边患与边政》、《中国边疆探察吏》等项目的研究。对于基础研究中的热点、难点问题，今后3—10年内陆续开展诸如黑瞎子岛问题、唐努乌梁海问题、南沙群岛问题、钓鱼列屿问题、中朝边界问题、中印边界问题，以及高句丽历史、渤海历史等方面研究，同时深化历代边疆政策的研究。
同时下大力气进行资料建设，在完成中国第一历史档案馆藏满文档案中国边疆目录的基础上，有计划进行相关档案的汉译汇辑工作，同时建设具有权威性的中国边疆研究信息库。
应用研究中抓住当代边疆社会稳定研究不放，在继续保持新疆社会稳定研究上国内领先地位的同时，开拓新领域，做好东北地区、云南和南沙群岛现状问题研究。
第二步，将边疆史列入一级学科历史学之下的专门史，作为二级学科，这一工作需要得到院科研局的协力才能完成。
第三步，完成中国边疆学的学科构筑，使中国边疆学成为一级学科，并列入人文社会科学诸学科之林，这一步的实施不仅需要中国社科院的支持，还要得到国家的承认。
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