然而，就在竺可桢逗留上海的日子里，一些浙大师生和上海浙大校友会还多次请求他返回浙大继续主事，不过，已在浙大服务了13年的竺可桢心意已决，何况此时竺可桢夫人也从杭州来信，向竺可桢明确表示：他“若回浙大，她就要分居”。那么，以下的场景就是最后的一幕了：

7月3日，上海浙大校友会举行年会，内容之一是热烈欢迎竺可桢校长。两周之后，北平中山公园又有浙大校友两百余人集会，恳切请求竺可桢回浙大继续长校，外语系学生裘克安甚至还提议发起请竺可桢回校的签名运动，此情此景，可谓情真意切，竺可桢为之动容，言不能答。但竺可桢仍在日记中说：“余表示决绝不干，谓余在浙大十三四年，自四十六以至六十岁，实为余之壮年时期。现已达衰老，应让余退休。因大学校长职务繁重，非老朽如余所能胜任也。”

10月16日，竺可桢出任中国科学院副院长。此前的9月16日，他与陶孟和、吴有训等联名写信给赵元任等旅居海外的学者，告知他们：上海解放四个月以来，“于人民政府领导下，各方面奋力建设均获相当进展”，因而热诚动员他们回国参加“新中国建设”。接着，竺可桢北上履新，开始了他人生的又一崭新篇章。

不过，在此后的历次政治运动中，服务浙大的13年，仍然是竺可桢绕不过去的一道坎。他不时要翻开日记，回忆那些风雨如晦的日子。

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