以色列突击队员截查前往加沙的救援船只，造成可能多达十九人死亡，有许多人受伤。马来西亚不同宗教吁请信徒一起为事件中的死伤者祈祷。

救援船当时试图冲破以国对加沙地带的海上封锁，船上最少有二十名马来西亚人生死未卜。

「首要全球和平组织」顾问穆赫里兹．马哈蒂尔（Mukhriz Mahathir）发表声明说：「我们呼吁马来西亚所有宗教的信徒为被劫持的国人及船上的其他人员祈祷。」

他续说：「我们希望所有国民团结一致，要求安全释放所有和平工作者。他们的目的祇是将紧急援助物资运送给加沙人民。」

袭击事件引起全球公愤，许多人要求国际社会合作，确保以色列为事件负责。

在首都吉隆坡，多个伊斯兰民间组织和政党的示威者，六月一日在美国大使馆外聚集，抗议以色列的行动。最少一百名侨居马国的巴勒斯坦人参与。他们焚烧和踏碎以色列总理内塔尼亚胡（Benjamin Netanyahu）的相片。

执政国民阵线党青年团在联合国驻马来西亚办公室外，践踏和挥动燃烧的以色列国旗，部分青年手持写着「惩罚以色列」的横额。

马来西亚大律师公会强烈指责袭击「具侵犯性和不可接受」。公会主席拉古纳特．凯萨万（Ragunath Kesavan）在声明中说：「这种明目张胆的袭击是可悲的，尤其是在公海和未有受挑衅的情况下，蓄意侵袭和平组织。」

驻马国的民间组织「公义世界国际运动」主席钱德拉．穆扎法尔（Chandra Muzaffar）发表声明说，事件「再次向世界显示这流氓政权就是如此，是恶魔的化身。」

与此同时，梵蒂冈和国际明爱也对事件表示震惊。教廷驻联合国常任观察员托马西（Silvano Tomasi）总主教在联合国人权理事会于日内瓦就袭击事件召开紧急会议时发言，要求对事件进行公正及透明的调查。

托马西总主教向《梵蒂冈电台》表示，他按照教宗表达的立场发言，指出暴力不会带来有建设性的结果。袭击行动必须得到谴责，尤其因为事件是在公海上发生，人道规则和国际法律不被重视。

他又说，事件说明，对加沙采取孤立政策起不了作用，首先需要积极回应加沙人民得到粮食、水、医药、教育的基本权利。国际社会和有直接关系的国家应努力寻求长远、持久的解决途径，就是一个巴勒斯坦国家和一个享有安全的以色列国家，促使双方不但遵守各自独立的原则，也要敞开合作的大门。