教宗本笃十六世5日访问塞浦路斯第二天上午，在与当地天主教友社团聚会后，前往东正教总主教公署拜访赫里索斯托莫斯二世总主教。教宗于12点15分左右来到具有新拜占庭风格的总主教公署，赫里索斯托莫斯二世总主教亲自出来迎接。两人进行了私人谈话后，先后发表致辞。
 
 塞浦路斯因巴尔纳伯的宣讲而接受了福音，今天，南部的人民以信奉东正教为主，天主教只是一个小小的羊栈。塞浦路斯东正教于1948年加入了世界基督教协进会，并活跃参加各教会间和各宗教间的活动，热心推动基督信仰教会间的大公合一。因此，教宗在致辞时，特别提到这个东正教会促进合一的努力。他指出，塞浦路斯东正教一向致力于对话，支持促进东方与西方教会完全而且有形可见的合一的工作。教宗说，这样的共融应该在对福音和宗徒传统的忠贞下体现出来。教宗感谢赫里索斯托莫斯总主教一年前来罗马访问，也为这个东正教会去年招待国际神学对话委员会在帕福斯举行会议而表达谢意。此外，他也感谢赫里索斯托莫斯总主教以塞浦路斯东正教的名义对去年意大利阿奎拉地震灾民的援助，教宗祝愿塞浦路斯全国人民，在天主的助佑下，获得智慧与力量，一同努力寻求一个合理的途径来解决塞浦路斯的问题，并努力寻求和平与修和，为下一代建造一个尊重所有人的权利的社会，这权利包括了不可剥夺的良心自由和敬礼自由权。面对中东持久的冲突状况，教宗强调了各教会作大公性努力的重要。他向在场的东正教代表和他的随员们说：“传统上，塞浦路斯被当作是圣地的一部分…………任何人都不能忽视需要尽一切可能支持这个饱受折磨地区的基督信徒，使那里的古老教会能够在平安和昌盛中生活。”教宗祝愿塞浦路斯所有的基督信徒社团作大公性合作，一同为圣地的和平、修和、稳定祈祷和工作。
 
 教宗致辞完毕，参观了东正教公署内的圣像博物馆、私人小圣堂、以及先总主教马卡里奥斯的历史性住所。随后，他与赫里索斯托莫斯总主教共进午餐。