青海玉树震情，惊动了全国各族人民的心，2010年4月16日，中国伊斯兰教协会召开全体干部职工大会，通报了玉树地震灾情，动员大家积极以实际行动向灾区同胞献爱心。在地震发生后，中国伊斯兰教协会第一时间向灾区发去慰问信，代表广大穆斯林向灾区各族人民致以最深切的慰问，对在地震中罹难的同胞表示最沉痛的哀悼。

2010年4月19日，中国伊斯兰教协会向各地伊斯兰教协会、清真寺民主管理委员会及教职人员、广大穆斯林群众发出倡议，号召大家发扬伊斯兰教救危扶困的精神，慷慨解囊，奉献爱心，向玉树地震灾区各族群众伸出援手，帮助他们减轻灾害，恢复生活。据初步了解，青海省伊协和穆斯林已向灾区群众捐款捐物达400余万元。

同一天，中国伊斯兰教协会还向各省、自治区、直辖市伊斯兰教协会发出了“关于为青海玉树地震灾区举行平安祈祷的倡议书”，号召穆斯林在主麻日为灾区人民进行平安祈祷，并为遇难归真的穆斯林教胞举行缺席殡礼，为伤者祈求早日康复，并祈求至仁至慈的真主慈悯众生，降赐平安。