2010年——2011年，由中国社会科学院考古研究所、吐鲁番研究院、龟兹石窟研究院３家单位合作，对吐峪沟石窟寺遗址实施了第一期保护性考古发掘工作。发掘出土了数量众多的纸质文书等珍贵文物，对研究吐鲁番历史文化提供了珍贵的新资料。该考古发掘项目当年被评为“2010年度全国十大考[注: 介绍 清代的一种考核官吏的制度.凡翰林院出身的中,下级官员.第十年左右,临时召集一次考试.不得以任何理由缺试,名为大考.考试结果,最优者予以特别升擢(音ZHUO二声)可由七品超升四品,劣等分别罚俸-]古新发现”。

　　今年4月，吐峪沟石窟寺启动了第二期考古发掘工作。此次发掘工作是第一期考古工作的延续。计划发掘面积为500平方米，发掘区域主要集中在吐峪沟沟口的地面佛寺，以及吐峪沟石窟寺西岸石窟群北部。相信随着考古工作进一步深入，必将会有更多新的发现。（吐鲁番地区文物局 安士佳）