在战争年代发生如此严重的疫情，其后果必然是灾难性的。最显著的莫过于人口的损失了。从前面引述的一些文献中，很容易发现瘟疫造成了大量人口死亡。在清代江南的历次瘟疫中，这是人口疫死率最高的一次，总的来说，这次瘟疫的疫病死亡人口所占比率大约在8—15%之间，一般不会超过20%。当然，在极个别地区，比如嘉兴的濮院，疫死率达四五成，也不无可能[69] 。太平战争前，江南十府一州的人口大约在四千万[70] ，若按疫死率8－15％的疫死率计，疫死人口多达3,200,000－6,000,000。这场瘟疫仅在江南就夺走了数百万人口的生命，不能不说是一场极其可怕的人间惨剧。 

战争导致了这场灾难，同时瘟疫本身也会对战争造成一定影响。军营是一个人口相对集中的地方，而且，生活卫生条件又相对较差，所以也往往是瘟疫最易爆发的场所。比如，同治元年，据曾国藩奏称，“大江南岸各军，疾疫盛行。……近日秋气已深，而疫病未息。宁国所属境内最甚，金陵次之，徽州、衢州次之。水师及上海各军，亦皆繁兴，死亡相继。”[71] 将士的大量染疾甚至死亡，必然极大影响军队的战斗力和军事部署的顺利实施。就在这一年，曾国藩曾数次具奏瘟疫的影响，七八月间，“金陵贼匪未扑官军营盘，曾国荃因营中病勇过多，亦未进攻。……左宗棠在浙，亦苦营中患病者多，不能指撝如意。”[72] 他奏言：“今岁夏秋以来，疾疫大作。昔时劲旅，顿变孱军。”[73] 这些都为臣子向上的报告，尽管不免存在为推脱责任而有意扩大瘟疫的危害的可能，但瘟疫对战争造成了一定的影响应是可以肯定的。只不过，当

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