优、年力强壮者为庶吉士，入馆再行学习，是为“馆选”。以庶吉士又称“庶常”，故学馆名为“庶常馆”。馆中设教习满、汉各一人，由院以应开列各官职名奏请钦定。“康熙九年定，以掌院学士或内阁学士领其事。……六十一年定，大学士、尚书、侍郎之不兼掌院事者并得掌教习事。”此外，又有“小教习”之设：“（康熙）三十三年奏准：汉庶吉士学习汉书，亦于侍读、侍讲、修撰、编修、检讨内择学问优长者为小教习，教习诗文四六”。至雍正八年停此制。[6]此外还设有提调、供事等员管理馆中日常事务。庶吉士在馆学习三年期满，由掌院学士奏请定期散馆。届期由皇帝御试，钦定甲乙，分发任用。
起居注馆，是记录皇帝日常言行、编纂起居注的机构，其官“不专设，以翰詹坊局官兼充。”因起居注官均同时兼日讲官，故署衔多作“日讲官起居注”。其员缺，“自掌院学士、詹事以下，坊局、编检以上，皆得开列请简，以原官充补”，掌院学士、詹事均得照例兼充。[7]日讲起居注官职司记注，所谓“簪笔左右，圣躬一言一动，书之简册，以垂永久。”[8]康熙九年，初设起居注馆于太和门西廊，设记注官满四人、汉八人，至五十七年裁去。雍正元年复设，有满记注官六员、汉记注官十二员，又设有主事、笔帖式、供事等官。“凡侍直，敬聆纶音，退而谨书之，具年月日及当直官姓名于籍”，“每月记注满汉文各二册”；“凡侍班所记，下直时备载于册卷末，汇为总跋。册中每页钤以翰林院印，贮之铁匣，扃鐍封识，岁终题明送内阁，会同内阁学士监视，藏之内阁大库”[9]。
国史馆，始设于康熙二十九年。是年，以修太祖、太宗、世祖三朝之史，诏开“三朝国史馆”，史成而馆撤。至乾隆元年下诏修史始重开，后又停。其成为常设之馆，自乾隆三十年十月再度开馆重修《国史列传》始。国史馆设总裁满、汉各一人，由皇帝于大学士、尚书、侍郎中简派，掌修国史。总裁以下有提调满、汉各二人，分由内阁侍读学士、侍读及翰林院侍读学士以下各官派充，掌章奏文移及管理吏员、差役等事。其下又设总纂（满四人、汉六人）、纂修（满十二人、汉二十二人），分掌编纂之事；校对（满、汉各八人），掌校勘之事。[10]
此外，尚有四译馆亦曾一度隶属于翰林院。顺治元年，清廷设四译馆，掌翻译远方朝贡文字，内分回回、缅甸、百夷、西番、
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