防建设首重兵舰、轮船的购置。杨昌浚、刘铭传原建议在台澎建立一支海军，以保卫台澎及东南沿海。后清廷决定先建北洋海军一支，原定为台湾购置的四艘铁甲快船，亦被编入北洋舰队，刘铭传乃退求其次，续请北洋分拨快船到台备用。如1884年曾在香港定造南通、北达、前美小轮三号，分拨澎湖、安平及沪尾各海口，用以缉捕、运输及通文报之用。1885年又购如川小轮一号，供南北各海口遣用。1887年复于英国承造飞捷水线船一艘，供修理电线及运输之用。
同时，自1886年开始，刘铭传开始在澎湖、基隆、沪尾、安平、旗后各海口，仿西洋新法兴修炮台，计澎湖、基隆、沪尾、安平、旗后五海口“共造炮台十座”（《刘壮肃公奏议》，卷五，第266—267页。），并添购后膛阿姆士顿钢炮31尊，以加强炮台的防务。刘铭传又奏请先购沉雷60，碰雷20，使“海防利器水雷与炮台相资为用”（《刘壮肃公奏议》，卷五，第263—264页。）。刘鉴于法舰封锁台湾时，内地武器*难以接济的教训，决定在台自行仿造枪械*，于1885年秋设军装机器局于台北大稻埕，以小机器厂制枪弹，大机器厂造炮弹，并在厂西建造军械所，以存储军械，继设火药局于大龙峒。
刘铭传又提出整军练兵，他认为“台湾军务，久号废弛”，“非讲求操练不可”。决定防军均改用洋枪，聘外国教习教练，且于台北设总营务处，直属巡抚，统辖全台军务，以“严定营规，坚明约束”。并与藩司沈应奎等详酌，除镇标练兵不计外，防军拟留35营，其分布：台南合澎湖15营，台北合宜兰15营，中路新竹、嘉、彰拟派5营（《刘壮肃公奏议》，卷二，第147页。）。调整全台兵力，重新布防，以加强陆路防守的兵力，并加强了后山的防卫力量。1886年又奏请澎湖副将与海坛镇总兵对调，并奏调吴宏洛为澎湖总兵，以加强澎湖的海防（《刘壮肃公奏议》，卷五，第247页；卷六，第287页。）。
3、修铁路、架电线以利调兵与通文报刘铭传为了巩固海防，极力倡办铁路等新式交通事业。早在1880年就倡议在中国兴办铁路，中法和议甫成，即请开办铁路，“良以台疆千里，四面滨海，防不胜防。铁路一成，即骨节灵通，首尾呼应”。他特别指出，“此中利害，自非身亲大难
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