关于卢沟桥事变
新版宣称：“1937年7月7日夜，在北京郊外的卢沟桥，发生了有人向日本军队开枪的事件。第二天，中国方面继续开枪，进入了战斗状态。事件本身不过是一个小摩擦，虽然人们希望就地解决，但是与日本方面的冲突事件不断发生，解决变得困难起来。”将卢沟桥事变完全算成中国的责任，是中国方面扩大了事态。
从《新历史教科书》的描述来看，中日战争的责任完全在中国，日本反而是受害者。此外，新送审本继续将8年战争描述为“目的不明的泥沼战争”，完全抹煞了日本希望灭亡中国的阴谋。
对外侵略称“借道” 不提“南京大屠杀”
《新历史教科书》对日本自古至今的历次对外侵略战争从来不用“侵略”二字，对丰臣秀吉入侵朝鲜，也称为出兵，右翼学者可笑地辩解说，为何不用侵略，是因为丰臣秀吉根本没把朝鲜看在眼里，不过是借道，真正的目的是征服中国明朝。
对于日本在战争中犯下的罪行，《新历史教科书》仅指出：“没有一个国家在战争中没有任何杀害和虐待非武装人员的事情，日本也不例外。”对日本军队所犯罪行提也不提。
关于南京大屠杀，2001年版的教科书在《日中战争》一节的正文中的括号内加了一句话：“（那时，日本军队导致民众中也出现了很多死伤者，这就是南京事件）”，将大屠杀以“事件”一词轻轻带过，但是在介绍远东国际军事法庭时，又以稍小的字体介绍：“东京审判认定日本军队在1937年的日中战争中占领南京时杀害了很多中国民众。但是关于事件的实际情况，资料上被发现有很多疑点，存在各种见解，现在仍在争论。”这就使括号中的那句话进一步大打折扣。
但是，在《新历史教科书》中，括号中的那句话也被删除了，只是在一张名为“因巷战而遭到破坏的上海市区”的照片上面用小字注解重复了上面的那句话。也就是说，教科书进一步否定了南京大屠杀的真实性，而且几乎不会使读者注意到南京大屠杀这个问题。
为战犯鸣冤叫屈 鼓吹“造福”亚洲
《新历史教科书》对日本在战争中的损失则大书特书，单纯强调日本的损失，“第二次世界大战末期，美国对东京等多数城市进行不加区别的空袭，并且在广岛和长崎投下了原子弹。”
同时，《新历史教科书》继续把盟军对日本的统治称为占领统治，而且改变了2001年版用较小字体介绍远东国际军事法庭非法性的做法，用正文等大字体介绍了远东国际军事法庭的非法性，为战犯鸣冤叫屈，同时指出“直到今天，评价也未确定”，显然是企图否认东京审判的合法性。
《新历史教科书》同时大力宣传日本“造福”了亚洲，是亚洲的“恩人”。如日本对台湾的殖民统治，增加介绍了八田与一在台湾南部兴修水利的内容。李登辉访日时就特意到石川县的八田与一故居参观，对此感恩戴德，与右翼分子情投意合。在赞颂日本对台湾的殖民统治的同时，2001年版教科书和送审本都企图否认中国自古以来对台湾的主权。
