对于明代西北地区卫所的研究在某种程度上实际与西北史地研究的各个主要方面相联系。它涉及到卫所设置与地方民族的关系，对地方民族管理和控御方式，地区的民族迁徙，地区的经济开发如屯垦、茶马贸易、西北马政、水利、农牧业等各方面。由于程利英《近二十五年来国内明代西域研究综述》（《喀什师范学院学报》25卷第1期，2004年）、《20年来明代西北民族史研究综述》（《西北第二民族学院学报》2004年第1期）、以及《1978～2003年国内明代宁夏研究综述》（《宁夏社会科学》2004年第2期）对相关研究论著已经有详细的介绍，此处不再赘述。

九边防务及其沿线都司卫所研究。明代遍设卫所，控御全国，而北疆防御形势尤为重要，而九边重镇，则为其中重中之重，经过有明一代不断的调整变化发展变迁，形成了明代独具特色的“九边”军制。学界对于“九边”军制演变、供饷体制、环境变迁、经济形态、以及移民等社会问题等各个领域研究成果斐然，然而对于卫所的一般建制与“九边”军制的区别与联系、“九边”军事形势变化对于卫所制度维系变化的影响等研究尚有待于加强。其中，肖立军《明代中后期九边兵制研究》（吉林人民出版社，2001年）在这方面的研究值得借鉴，该书在明代边兵的种类与任务、边防将帅的权限及上下关系、九边兵制与明朝整体兵制的关系等方面做了有益的探讨[1]。

山西尤其是其宣大地区是明代边防的重镇，山西行都司是明初这一地带的主要管理机构。郭红《山西行都司建置沿革考实》（《中华文史论丛》第七十二辑）对大同都卫、山西行都司及其所属卫所沿革进行了初次系统翔实的考证。接着，他又在《明代山西行都司移民》（《军事历史研究》2000年第 3期）一文中，对明初山西行都司卫所移民的来源、分布、移民及后裔对当地的影响展开了论述。张金奎《明代山西行都司卫所、军额、军饷考实》（《大同职业技术学院学报》2000年第3期）在考察山西行都司卫所的置废变迁的基础上，对其兵额变化、粮饷供应体制和渠道的变化和军政腐败等一系列相关问题展开了系统的梳理和论述，尤其对九边军饷供应体制作出了有益的探索。

其他对北方卫所进行考辨的文章也深入了卫所的研究。韦占彬《兴州五卫与兴州五屯卫考辨》（《石家庄师范专科学校学报》2001年第2期）认为兴州五卫之说都不可信，兴州五屯卫设于洪武二十八年，同时也对“卫”与“屯卫”作了一定的区辨。南炳文《解开天津右卫创建史上的两个谜团》（《中国地方志》2005年第4期）通过征引大量可信史料,最终考证:天津右卫创建于永乐四年，其前身为青州左卫，解开了关于天津右卫创建时间及其前身问题上的两个历史谜团。李逸友《明开平卫及其附近遗迹的考察》（《内蒙古文物考古》1999年02期）从文物考释的角度对开平卫利用元上都城址建卫城并其相关墩台、驿站遗址作了初步说明。

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